Desa Wonogiri pada awalnya merupakan daerah pegunungan dan hutan belum ada kehidupan manusia. Kurang lebih tahun 1905 mulai dihuni oleh beberapa tokoh pendiri desa diantaranya dalah Raden Jogo Nolo, Raden Jogo Wedono dan Raden Jogo Tirto dari Kasunanan Surakarta karena tempat yang tadinya daerah pegunungan dan hutan maka beliau menamakan desa dengan nama Wonogiri yang terdiri dari dua kata yaitu wono yang mempunyai arti alas dan kata giri yang memiliki arti gunung. Seiring perkembangan penduduk maka dibentuklah beberapa dusun yang terdiri dari Dusun Tuwanan, Dusun Salakan/Tangkil, Dusun Ngemplak/Bleber, dan Dusun Sabrang/Bompon.
Adapun Desa Wonogiri dibagi menjadi 4 (Dusun) Dusun, yaitu :
1. Dusun Ngemplak Bleber
2. Dusun Tuwanan
3. Dusun SalakanTangkil
4. Dusun Sabrang Bompon
Adapun Kepala Desa Wonogiri semenjak berdirinya Desa Wonogiri adalah sebagai Berikut :
yang pernah menjabat antara lain, yaitu:
1. Kepala Desa 1 : Joyo Wigno/ Berah
2. Kepala Desa 2 : Reso Wijoyo
3. Kepala Desa 3 : Ahmad Dasir
4. Kepala Desa 4 : Maliki
5. Kepala Desa 5 : Bakri
6. Kepala Desa 6 : Wiryo Sudarmo
7. Kepala Desa 7 : Dollah Satori
8. Kepala Desa 8 : Djariono
9. Kepala Desa 9 : Sabarno
10. Kepala Desa 10 : Mansur
11. Kepala Desa 11 : Chamim
12. Kepala Desa 12 : Junarsih
13. Kepala Desa 13 : Junarsih